关东各州县大多畏惧王仙芝、黄巢这波草寇，都坚守城池，紧闭城门，躲在城里不敢出来。王仙芝、黄巢率军在河南、湖北一带四处游击，专门往朝廷官军薄弱的地方钻。十月攻打唐州（今河南唐河）、邓州；十一月继续南进，一举攻占郢州（今湖北京山）、复州（今湖北沔阳）；十二月攻随州（今湖北随县）。这一路转战，群豪肆意倾泻着他们对朝廷的愤怒，于所过之处大肆烧杀抢掠。
人类最原始的愤怒被激发了出来。长期被地主豪绅巧取豪夺、欺瞒压迫的农民、流氓加入了流寇队伍，他们对豪绅们多年来积攒的愤怒转化为血腥的杀戮。当初夺取他们的田地，他们现在便烧了地主的老宅！当初强占他们的儿女，他们现在便强暴地主的老婆！跟随着大军，人们闯入地主豪绅的家宅，疯狂地烧杀抢掠，那些小姐姐、少奶奶们的牙床上，他们也要踏上去，滚一滚。
淮河与长江之间，群豪所过之处，几乎断绝了人烟。
就在群豪们一路转战、到处放火，官军们追着草寇们焦头烂额、顾此失彼的时候，《水浒传》里的情节又一次提前上演了——草寇的首领考虑起了接受朝廷招安的问题。
只不过这回想要接受朝廷招安的，不是群豪中的“宋江”，偏偏是那位“晁盖”。
当群豪抵达蕲州（今湖北黄冈）时，蕲州裴渥不能抵抗，打开城门迎接王仙芝入城。但裴渥提出了一个新的方案：若是接受招安，他可以以河东裴氏的名誉担保，为王仙芝上表求官。而这个要求正中王仙芝下怀。
王仙芝考虑投降朝廷，其实也是在为这支队伍的未来做打算。
自古以来，落草为寇者都被视为朝廷要犯、流窜盗匪，一般的下场无非是两个：一个是被平定、剿灭，被朝廷官军堆起来做成京观，或者把人头挂在城墙上，比如几年前的裘甫、庞勋；另一个便是接受招安，成为正规军，吃朝廷的俸禄，做朝廷的官。大多数草寇的下场都是第一个，后面这一条路要是走通了，那就是祖坟冒青烟，极为难得。像大唐开国时的瓦岗寨群豪，一部分死在了战场上，另一部分比如李勣、程知节、秦叔宝等人，则成功投靠了初生的大唐，随后出将入相，画像挂在太极宫凌烟阁上，享受着世代的敬仰。
王仙芝带着队伍从黄河边的曹州一路兜兜转转，打到了长江边的蕲州，美其名曰“转战”，其实是被官军追着打，队伍越打越少，从最盛时的数万人减少为五千人，全靠一部分中坚力量的支持，才没有被打散建制。一年多了，他们一没有根据地，二没有稳定的补给，实在可以用朝不保夕来形容。至于这支队伍的未来，明眼人都感到悲观，不被剿灭已经是老天保佑了。指望这支流寇队伍打出一片江山来，那几乎就是痴人说梦。
所以，王仙芝踌躇了一会儿，答应了下来。不久之后，裴渥的上表得到了朝廷的积极回应，朝廷特批，任命王仙芝为“左神策军押牙兼监察御史”，其实就是把这五千草寇收编到皇帝直属的神策军麾下。
前一天还是流寇，转眼变成了吃天下最高档皇粮的禁军，这样的待遇不能说不好。王仙芝自然非常满意。只是大当家“晁盖”答应了，问过二当家“宋江”的意思了吗？
当王仙芝召集众头领、降官商议时，被俘的朝廷官员王镣、裴渥纷纷道贺。可黄巢看着朝廷的文书，从头到尾就只看到王仙芝的名字，却对黄巢的人事任命安排只字不提。这让黄巢心中气愤不平。他当即对王仙芝说：“当初我们曾共同立下誓言，要横扫天下，现在唯独你去神策左军当官儿了，让我们这五千多人回到哪里去？”
这一句话挑动起了众头领的情绪。众头领的心态爆炸了，一下子对王仙芝破口大骂。借着群情激愤，怒不可遏的黄巢趁机一个耳光打在王仙芝脸上。王仙芝脸上赫然现出五指红印，另一半脸青一阵白一阵，又尴尬又气恼，拂袖而走，招安之事便就此搁浅，无人再来问津。
平心而论，黄巢这番话其实是偷换了概念。朝廷虽然只任命了王仙芝为左神策押牙，但其实已经包含了其他众头领和小喽啰们的安排。神策军是禁军，昔日曾有极强的战斗力，但是近年来士气、训练度下降得厉害，渐渐变成了少爷兵。朝廷也许想借收编王仙芝的队伍来增强神策军的战斗力，这样的情况也有先例可循，过去的许多叛乱队伍，朝廷都将其改编为神策军，作为禁军的外围力量，到现在也都过得好好的。群豪们接受了招安，便是有编制、领工资军饷的禁军将士，那可是别人求之不得的事情。
但黄巢却有着自己的私心，他不甘心接受招安，他要做的可不是神策军中的一员小小将领，而是挞伐天下的大魔王。谁说落草为寇的下场只有两条路？不要忘了，周隋帝国是怎么起来的？李唐皇室是怎么起家的？对于流寇们来说，其实还有第三条道路，一条自古以来就罕有人走通，可一旦走通就是惊天动地的道路，那就是像当年的武川豪杰那样，趁着六镇之乱起兵，然后自己成就一番大业！
如果没有黄巢插上一手，王仙芝之乱也许就像庞勋之乱一样，在朝廷妥协与镇压的组合拳之下草草结束了。而关键时刻黄巢推出的这一手，把这支草寇队伍乃至整个大唐天下，推向了最为混沌未知的结局。
蕲州城里，群豪队伍开始大肆剽掠，他们挨家挨户逼问索要财物，若是不愿意，便放火烧他们的家宅。城中登时大乱，抢劫演变成了屠杀，一半人逃到了城外，剩下的百姓们则免不了被乱军残杀。到了这时，已经没人能说清楚，究竟是因为王仙芝不接受朝廷委任而发动劫掠，还是黄巢故意驱使部下屠城，倒逼王仙芝拒绝朝廷的委任。
至此，群豪队伍彻底分裂了。黄巢带领两千余名部众北上，脱离了队伍。蕲州已是一片焦土，不是久留之地，王仙芝只好带着其余三千人，转战其他地区。