九月，清廷贝勒博洛、尼堪击败吴淞义军，率马、步二十余万尽来江阴，将义师首领吴淞总兵吴志葵、镇南伯黄蜚缚于十方庵，命作书招降。

蜚曰：“我与城中无相识，作书何用耶？”

次日清军兵临城下，博洛命二人于城下招降，黄蜚默然不语，吴志葵涕泪交横，仰头劝众人早降。

应元叱曰：“汝为大臣，不能斩将立功，一朝为所缚，自应速死！”

吴志葵大泣拜朝。

博洛见城中拒绝招降，随发兵攻打，他认为刘良佐曾任大明伯爵，手握重兵，却连一个小小的江阴城都打不下来，于是便打了他一顿板子。

刘良佐惭恨不已，随督促部下拼命攻城，而这时攻打的清军，已经达到二十四万之众。

陈、阎二公，与乡民义勇扼守危城，逐渐不支，随派遣徽商程璧等人，先后出城，联络各地义师来援。

江天一遁出群山来援，为清将卜从善伏击，败回山中。

陈子龙、吴易领战船来援，为清将李成栋所阻拦，大战一日，部将于世忠受重创，吴毅山断三指，依然不能破敌，随退回太湖。

东海之上，有海寇顾三麻子，因敬慕阎应元的为人，率舟师来援，苦战三日后失败，扬帆远去。

此外，义阳王来援，败于砂山。

秀才金矿会集精勇四百余人来援，被刘良佐以铁骑三千截在周庄左右，全军俱没。

九月底，各路援军尽数失败，而清军攻势日急。

十月初，清军集中火炮轰击城东北角，城墙坍塌，清军蜂蛹而上，江阴失守。

清军拥入城中，陈、阎二公犹组织义民巷战，陈公閤门投水死，阎公负伤后投湖，被清军从水中拖出，不屈而死。