其中甚至不乏某些天性残忍的神奇动物，违背契约规定主动伤害炼金师的例子。更有一些时候，又因为神奇动物们在互相争斗的过程中直接死亡，这也给炼金师们带来了非常大的麻烦。毕竟在炼金道具的炼制过程中，持续而稳定的魔力输入是绝对不可少的。

慢慢的，跟神奇动物们签订契约的炼金术师变得越来越少，而和恶魔签订契约的炼金师越来越多。最后，契约恶魔成了炼金术师们突破自身魔力极限的主流方法。

但是有利自然也有弊，契约恶魔当然也有不好的一面。

虽然和契约神奇动物比起来，与恶魔签订契约会更加稳妥，但是恶魔在与炼金术师们签订契约的同时，也一般会在契约之中要求非常多血腥残忍的附加条件，这也导致了和恶魔签订契约的部分炼金师们逐渐变得臭名昭著。

最终跟恶魔签订契约的那些炼金师被神圣教称为是黑暗炼金师，他们炼制出的强大炼金道具也被称作魔具。

再后来，炼金战争就爆发了。

越来越多的炼金术师主动和地狱的恶魔签订契约，在整片欧罗巴大地上掀起了一片又一片的血腥狂潮。他们扭曲心灵，散播疫病，收割灵魂，操纵空间，玩弄时间，几乎是无恶不作。

而自诩为混乱邪恶的黑暗炼金师，自然被天生代表秩序和规则的神圣教之间爆发过无数次的矛盾。随着矛盾的积累，战争终于来临。

战争初期，黑暗炼金师们一度在恶魔以及炼金道具的帮助下，获得过巨大的优势。但是仍旧被神圣教艰难地撑了下来，一直撑到了他们得到了天堂的回应之后，战争的场面才开始有了变化。

历经了数百年时间的炼金战争之后，神圣教最终终于在天使的帮助之下，成功地战胜了黑暗炼金师以及他们的恶魔军团。然后又在神圣教和天使一起努力下，直接封印了从地狱到人间的入口，黑暗炼金师们想要和恶魔签订契约变得再无可能。

为了避免战争的再次来临，胜利之后的神圣教还主动进行了数次残酷至极的整肃运动。一方面直接摧毁了当时仍旧存留于世的大部分炼金典籍和炼金资料，另一方面还破坏了那些由黑暗炼金师们炼制出来的所有魔具。而一些威力过于强大、不能够直接摧毁的魔具，也被神圣教牢牢地镇压在了中央教堂的地底最深处。

炼金师一脉自此基本完全销声匿迹，炼金典籍前不存一，前人留下的智慧结晶也几乎丝毫不剩。现在还在外界流传的不过只是黑暗炼金师们留下来的一些残渣而已，就连神圣教都不把它们放在眼里。