距今6000年左右，各地考古文化出现了城址、铜器等符合国外文明标准的现象。大溪文化城头山遗址（在湖南澧县），有我国已知最早的城址，城内分区布局很明显，地面铺江陶土块，有水井，有专门的制陶作坊区。马家窑文化有铜渣和青铜刀，义井文化有铜渣，不论青铜的发现是否偶然，发现则是事实，应被称为原始八卦历的八角星图案在这一时期出现于华东一带，它们代表了中国的“河图”、“洛书”，是历法的表现形式，黄河流域的仰韶文化扩展到非常广泛的区域，应是神农氏王天下的体现。房屋朝向中心广场的现象代表了人们对于部落（早期中国？）的向心力。
距今5000年左右，各地城址增多，许多地区进入国家阶段。大地湾的宫殿式建筑，尉迟寺的“豪华”房子，凌家滩、红山文化冶炼青铜的遗迹及青铜器，表明中国在5000年前确实出现了国家。但这种大范围的文化上的光辉，却不如仰韶文化的“大一统”来得广泛。《史记.五帝本纪》说黄帝“未尝宁居”，征战不止，看来没有神农氏那样的统一文化的结果，这应归因于各地方文化大发展，个性更多地保存下来。
少昊未居帝位，《史记》、《竹书纪年》相同，但少昊把文化传到美洲，时间应按玛雅历起点公元前3114年。这个时间反过来可以说明黄帝生活在5000多年前，已有距今5000和5500年的观点。后者更可信。红山文化“女神庙”，供奉对象应是真人，并非虚构的神。母系社会实行图腾崇拜，即使崇拜妇祖先，也应是后来的事。王大有先生指出，红山文化玉器的造型均与黄帝族的图腾有关。这些图案、造型绝不是为艺术而艺术，而是宗教的产物。据纬书及《史记.封禅书》所引，黄帝应有十世，几百年。退居华北北部以后黄帝族衰落了。华北一带颛顼、帝喾、尧、舜相继为王。从考古学文化来看，这一时期，龙山文化有过繁盛的局面。当为尧舜禹的时代。文献记载关于这一时期相对丰富一些，但考古工作还不够充分。龙山文化有文字，可是没有当时留下的史事记录原件。作为年代框架，要做的事并不比夏代容易。要想分清各王的年代，如没有新的发现，就无法精确到年。
由于禹继舜为共主，双传子启“家天下”，没经过“革命”，考古文化不会有本质的剧变。龙山文化的年代被确定在公元前2600——2000年，尧舜禹三人合计在位时间不会超过200年，但一般把公元前2600——2200年看成尧舜时代，400年不可能只属于二三个王的纪年。二里头文化与龙山文化的过渡类型引发的争论不影响“先入为主”的研究结果，因为这一时期已有文献记载的资料供参考。尧舜之上，颛顼、帝喾活动中心在河南及周边地区，是否如纬书所称各为数世应予以关注。古人早已指出，《左传.文公十八年》说的“高阳氏有才子八人......高辛氏有才子八人......此十六族者，世济其美联社，不陨其名，以至于尧”。表示高辛至尧非一二世，若“八世”与尧同为帝喾之子，谈不上“族”，“世济其美，不陨其名”。夏、商、周始祖同处一个时代的事实体现了“国家联盟”下的格局。
一般认为黄帝元年为公元前2697年或2698年。这是据文献推算出来的。实际上晚了近一千年。正是这一结果，导致学术界把黄帝、尧、舜、禹都列入4000年前的传说之中。
三皇五帝时代断代研究，早期是文明肇始的阶段，考古发现应注重“异”，即最先表现较高的文化的东西。后期是文明高度发展的阶段，考古发现应注重“同”，即共性。目光不应只放在中原一带。辽西、四川等地的文明进程可以称作中国上古的特殊代表。文献表明上古时代各地的联系比人们想像的要密切。盘古王表有一定的研究价值，《山海经》古史重点在三皇五帝时代，因其记述的范围很广大，未进行深入研究者很难相信。实际上《山海经》关于中国先民活动范围的记载是可信的。北亚、美洲、太平洋诸岛是中国先==要活动区域，考古、语言、民俗及对古今居民体质（现在可以加上基因）的研究，是增加我们对于上古史的认识的重要手段。带着先入为主的目的去研究古代美洲文明，方法对头，是全面研究中国上古史的必要组成部分。
图腾是有历史学价值的重要信息。《史记》中的“神话”大都是图腾崇拜的真实反映。《史记.秦本纪》：“大廉玄孙孟戏、中衍，鸟身人言。帝太戊闻而卜之使御，吉，遂致使御而妻之。......”商代初期还有鸟身的人为帝御？说不可信，但是其后代就是这么认识的。《山海经》的“怪”大都是图腾像的描述。这些成体系的记载可以称作中国上古史的图腾版本。尤其是炎帝、黄帝世系的记载，与其它文献不同。夸父猴图腾的分布，远达北亚和美洲，又有灵宝仰韶文化特大型聚落的考古学证据，说明夸父确有相当大的实力。黄帝一个支系叫韩流，猪图腾，《史记》等书无载，惟《竹纪年》有“乾荒”与之相应。考良渚文化、红山文化非同寻常的猪图腾，说明韩流是存在的，有相当大的影响力。尧时的“封豨”也是猪图腾。如果说文字证据可能找不到，那么图腾证据则保存下来了。这是中国上古史的一件幸事。盼望更多的专家像王大有先生一样把图腾形容融入古史寻证中，不可辜负了《山海经》啊！
对于三皇五帝时代的文化，考古未必能再现原貌。学者据贾湖遗址占卜实物考证伏羲作八卦是可信的。据《史记.天官书》和易洛魁人、玛雅人的实际，表明黄帝考定星历、羲和占曰、常羲占月、蚩尤明天道是史实。二十八宿产生很早，黄帝时已在应用是千真万确的。文献可以通过考古以外的途径验证，拘泥于出土物有时反而会低估上古文化的水平。
我们有责任弄清中国文明起源与发展的来龙去脉。中国上古史再也不能“一头雾水”，模糊下去了。那种怀疑中国文明早期阶段——三皇五帝时代的观点，必须被多学科、多角度的实证来说服。
所谓三皇，即燧人氏时代（5万—1.5万—7724年bc），伏羲氏时代（7724—5008年bc），炎帝神农?尤时代（5000—4513年bc）。而五帝时代，即黄帝时代（4513—4050年bc），颛顼时代（4050—3380年bc），尧舜禹时代（3380—2073年bc）。这个三皇五帝，作者作出了各种年表，为三皇五帝的编年史提供了可靠的依据，为研究中国古代史开辟了一个新的天地。
炎帝时代，炎帝氏族已经进入农耕社会，而黄帝氏族尚是一个游牧民族，农耕民族英武不足，而游牧民族好勇善斗，因此黄帝战败了炎帝，入主中原，成为中华民族万世一系的源头。作者认为把黄帝当作正统，是一种封建史学观。今天我们称为“炎黄子孙”，实际是炎帝与黄帝的联合，也是中华民族团结的象征。作者要求清算《古史辩》之类的伪学派和西洋文化模式的民族教条主义。
三皇五帝时代的历史序列大系：
（一）燧人氏时代（1.5万年～7724年b?c）。中国文明发祥于昆仑丘，燧人氏在昆仑山（今甘肃合黎山、龙首山，《山海经》载昆仑山在此）立天表，作为天齐，确立天北极，由?兹氏雷泽氏（时居龙首山、山丹河），创制结绳纪历的《河图》、《洛书》，为北斗九星悬朗时代，依章动岁差计算创制于1.48～1.47万年间。
（二）伏羲氏时代（7724～5008年b?c）。据《易》帝出乎震，建寅作孟春，28宿始于大角、角，依章动岁差计算7750～7675年b?c称帝，校正为7724年b?c。又据苗族古歌，伏羲称帝号“罗奉”，公元前7724年为罗奉元年，初都榆中，迁榜罗，再迁陈仓、华山牛鸠原、王屋山，崩鸡公山。汉湖南长沙楚帛书乙篇载伏羲氏族谱系。河南舞阳贾湖遗址为太昊遗址，自公元前7000～5800年，共1200年，发现文字25字，七声音阶骨笛25支，以及牙璋、白龟等，南传于淮河青莲岗文化龙虬庄，发展为大汶口文化。伏羲上元太初历年代为公元前104＋4617＝4721年，已进入神农氏时代。
（三）炎帝?神农?蚩尤时代（5000～4513年b?c）。大地湾—老官台文化—仰韶北首岭半坡文化是炎帝?神农氏文化；磁山?斐李岗?龙虬庄?北辛文化是蚩尤氏文化。贵州安顺关岭红崖丹书是炎帝族自六盘山南下四川—贵州—云南的共工支所留族谱，《山海经》载有炎帝九世的族谱，第九世为夸父，时居潼关至灵宝三百里桃林塞夸父八大社（营）；神农氏第八代名榆罔（参庐），都河南卢氏县祁村湾、陈留、曲阜；蚩尤氏与共工氏据晋、冀、鲁。蚩尤死葬濮阳西水坡m45，时公元前4515～4510年。
（四）黄帝时代（4513～4050年b?c）。《黄帝四经》出土，记黄帝与蚩釉击战事及颛顼与共工（时称涅）征战事。河北涿鹿有黄帝城、蚩尤城、蚩釉化、阪泉之野张公泉（共工氏汉姓张）、釜山会盟石仰韶文化遗址。红山文化是黄帝族文化。
（五）少昊颛顼时代（4050～3380年b?c）。山东大汶口文化和江苏连云港云台山将军岩刻文字、天文历法历是少昊文化。河南仰韶文化大河村类型是颛顼?鹳兜族文化，始自4000年b?c，第三期3685±125年b?c。此期的文化特征在北美洲加利福尼亚圣塔?巴巴拉海湾地区原封不动地移植，时在3641～3113年b?c，为玛雅历起算年，即山东少昊颛顼裔民迁入美洲的年代。其后鹳兜氏迁入郑州西山古城。仰韶文化早期庙底沟文化是其文化。共工氏时居浊漳河上游涅水（今仍此名）。